
栽培金柑的起源與山金柑有關嗎? 目前並沒有科學證據
(神秘的地球uux.cn報道)據EurekAlert!:金柑(Fortunella spp.),因其璀璨奪目,味美芬芳的小柑果,既是一種水果作物,又是優良的觀果花卉。栽培金柑種質(羅浮,F. margarita;金彈,F. crassifolia;羅文,F. japonica)均起源於中國,其中羅浮由英國植物學家羅伯特·福瓊(Robert Fortune)在清道光年間首次引進到歐洲。山金柑(F. hindsii)從古至今廣泛分布於中國華南地區和東南沿海,因其矮化、童期短、單胚有性生殖等特點,目前是柑橘基因功能研究的良好模式材料。然而,在過去的一個世紀裏,關於金柑屬的問題困擾著柑橘科學家:栽培金柑種質與現存唯一的金柑屬野生種,山金柑(F. hindsii),之間的係統發育關係是什麽?栽培金柑是直接從山金柑馴化而來的,還是起源於山金柑與柑橘屬植物的雜交呢?以沃爾特·施溫格(Walter T. Swingle, 1871-1952)和田中長三郎(Tyôzaburô Tanaka, 1885-1976)為代表的東西方學者均針對此問題提出過猜想,並認為該問題值得深入研究。
為了回答這一科學問題,鄧秀新教授和他的團隊在過去的10年裏係統地收集了中國各地的代表性栽培金柑品種和野生山金柑樣品,利用核SSR、葉綠體SNP和基因組SNP對金柑屬的遺傳多樣性進行了綜合評價,並追溯了其演化曆史。遺傳分析表明,金柑屬在柑橘類群中具有獨立的係統發育地位,拒絕了金柑屬雜交起源的假說。此外,金柑屬內具有明顯的遺傳結構,呈現分化程度極高的兩個種群:栽培金柑種群和野生山金柑種群。基因組分析表明,這兩個種群在演化過程中都經曆了定向選擇,但方向不同。進一步的群體基因組學分析和種群動態分析顯示,在第四紀冰期的進程中,栽培金柑種群的祖先和野生山金柑種群的祖先的種群動態並不是同步的,並且這種種群異步動態早於中國華南地區有人類活動的時間;在這兩個種群間發現了非常有限的馴化信號,並且這些信號與兩者的表型差異,如中果皮加厚、積累糖分、耐寒性等的相關性極弱。這些結果均指向栽培金柑很可能不是直接從野生山金柑馴化而來的。
根據本研究的結果、前人譜係地理學報道,以及施溫格和田中的假說,鄧秀新教授和他的團隊提出了全新的金柑屬演化曆史和起源假說。金柑屬共同祖先從柑橘屬分化出來以後,逐漸形成了一個獨立的種係,該種係曾廣泛分布於中國華中和華南地區。隨著第四紀冰期的進行,該種係的北方種群(栽培金柑的祖先)和南方種群(山金柑的祖先)逐漸被地理隔離(南嶺可能是隔離屏障),並最終形成了遺傳隔離和分化。北方種群麵臨更早和更嚴酷的自然選擇,因而更早地經曆了種群數量的銳減,最終導致適應性演化,如中果皮增厚並富集糖、酸和次生代謝產物,以保護種子免於霜凍。南方種群則經曆了中等強度、較晚發生、持續時間較短的自然選擇,從而在一定程度上保持了金柑屬的原始表型。隨著人類向南遷移,北方種群中的個別個體被人類選擇並加以栽培,因而存活至今(原始的野生北方種群可能已經滅絕),分別被命名為羅浮(F. margarita)、金彈(F. crassifolia)和羅文(F. japonica)。南方種群主要經曆了連續的自然選擇,並廣布於中國華南地區和東南沿海,先後被中國古代園藝學家和現代西方學者發現,被命名為“山金柑”(宋·韓彥直)和Hong Kong kumquat(Walter T. Swingle)。
本研究是一項大膽且創新的研究,收集的材料、研究數據和結論為金柑屬植物的育種和保育遺傳學研究打下了堅實的基礎。新提出的演化假說也為徹底解析該屬及柑橘亞科植物係統發育關係和演化曆史提供了全新的視角。但值得注意的是,該研究所提出的假說仍需要更堅實的證據加以佐證,如相關的化石證據,以及更高維度、高解析度的分析方法加以確認,如泛基因組對比等。該研究已於2022年發表在《農業科學與工程前沿》期刊上,DOI: 10.15302/J-FASE-2021436。
(责任编辑:米蒂)